TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Research Article Compressive Sensing DNA Microarrays"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Research Article Compressive Sensing DNA Microarrays | Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2009 Article ID 162824 12 pages doi 2009 162824 Research Article Compressive Sensing DNA Microarrays Wei Dai 1 Mona A. Sheikh 2 Olgica Milenkovic 1 and Richard G. Baraniuk2 1 Coordinated Science Laboratory University of Illinois at Urbana-Champaign Urbana IL 61801 USA 2 Department of Electrical and Computer Engineering Rice University Houston TX 77005 USA Correspondence should be addressed to Wei Dai and Olgica Milenkovic milenkov@ Received 30 July 2008 Accepted 23 October 2008 Recommended by Ulisses Braga-Neto Compressive sensing microarrays CSMs are DNA-based sensors that operate using group testing and compressive sensing CS principles. In contrast to conventional DNA microarrays in which each genetic sensor is designed to respond to a single target in a CSM each sensor responds to a set of targets. We study the problem of designing CSMs that simultaneously account for both the constraints from CS theory and the biochemistry of probe-target DNA hybridization. An appropriate cross-hybridization model is proposed for CSMs and several methods are developed for probe design and CS signal recovery based on the new model. Lab experiments suggest that in order to achieve accurate hybridization profiling consensus probe sequences are required to have sequence homology of at least 80 with all targets to be detected. Furthermore out-of-equilibrium datasets are usually as accurate as those obtained from equilibrium conditions. Consequently one can use CSMs in applications in which only short hybridization times are allowed. Copyright 2009 Wei Dai et al. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. 1. Introduction Accurate identification of large numbers of genetic sequences in an .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.