TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Research Article Algorithms and Complexity Analyses for Control of Singleton Attractors in Boolean Networks"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Research Article Algorithms and Complexity Analyses for Control of Singleton Attractors in Boolean Networks | Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2008 Article ID 521407 16 pages doi 2008 521407 Research Article Algorithms and Complexity Analyses for Control of Singleton Attractors in Boolean Networks Morihiro Hayashida 1 Takeyuki Tamura 1 Tatsuya Akutsu 1 Shu-Qin Zhang 2 and Wai-Ki Ching3 1 Bioinformatics Center Laboratory of Biological Information Networks Bioinformatics Center Institute for Chemical Research Kyoto University Uji Kyoto 611-0011 Japan 2 School of Mathematical Sciences Fudan University Shanghai 200433 China 3 Advanced Modeling and Applied Computing Laboratory Department of Mathematics The University of Hong Kong Pokfulam Road Hong Kong Correspondence should be addressed to Takeyuki Tamura tamura@ Received 12 January 2008 Revised 4 April 2008 Accepted 2 June 2008 Recommended by Ilya Shmulevich A Boolean network BN is a mathematical model of genetic networks. We propose several algorithms for control of singleton attractors in BN. We theoretically estimate the average-case time complexities of the proposed algorithms and confirm them by computer experiments. The results suggest the importance of gene ordering. Especially setting internal nodes ahead yields shorter computational time than setting external nodes ahead in various types of algorithms. We also present a heuristic algorithm which does not look for the optimal solution but for the solution whose computational time is shorter than that of the exact algorithms. Copyright 2008 Morihiro Hayashida et al. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. 1. Introduction One of the important challenges of computational systems biology and bioinformatics is to develop a control theory for biological systems 1 2 . Development of such a control theory is interesting .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.