TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Feature-level exploration of a published Affymetrix GeneChip control dataset"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Minireview cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Feature-level exploration of a published Affymetrix GeneChip control dataset. | Correspondence Feature-level exploration of a published Affymetrix GeneChip control dataset Rafael A Irizarry Leslie M Cope and Zhijin Wu A comment on Preferred analysis methods for Affymetrix GeneChips revealed by a wholly defined control dataset by SE Choe M Boutros AM Michelson GM Church and MS Halfon. Genome Biology 2005 6 R16. Addresses Department of Biostatistics Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health 615 North Wolfe Street Baltimore MD 212052179 USA. tDepartment of Oncology The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center Johns Hopkins University 550 N. Broadway Suite 1131 Baltimore MD 21205 USA. Center for Statistical Sciences Department of Community Health Brown University 167 Angell Street Providence RI 02912 USA. Correspondence Rafael A Irizarry. Email rafa@ Published I September 2005 Genome Biology 2006 7 404 doi gb-2006-7-8-404 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2006 7 8 404 2006 BioMed Central Ltd In a recent Genome Biology article Choe et al. 1 describe a spike-in experiment that they use to compare expression measures for Affymetrix GeneChip technology. In this work two sets of triplicates were created to represent control C and experimental S samples. We describe here some properties of the Choe et al. 1 control dataset one should consider before using it to assess GeneChip expression measures. In 2 and 3 we describe a benchmark for such measures based on experiments developed by Affymetrix and GeneLogic. These datasets are described in detail in 2 . A web-based implementation of the benchmark is available at 4 . The experiment described in 1 is a worthy contribution to the field as it permits assessments with data that is likely to better emulate the nonspecific binding NSB and cross-hybridization seen in typical experiments. However there are various inconsistencies between the conclusions reached by 1 and 3 that we do not believe are due to NSB and .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.