TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Prediction of synergistic transcription factors by function conservation"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Critical Care giúp cho các bạn có thêm kiến thức về ngành y học đề tài: Prediction of synergistic transcription factors by function conservation. | Open Access Method Prediction of synergistic transcription factors by function conservation Zihua Hu Boyu Hu and James F Collins Addresses Center for Computational Research New York State Center of Excellence in Bioinformatics and Life Sciences Department of Biostatistics Department of Medicine University at Buffalo State University of New York SUNY Buffalo NY 14260 USA. Duke University Durham NC 27710 USA. Department of Exercise and Nutrition Sciences University at Buffalo State University of New York SUNY Buffalo NY 14260 USA. Correspondence Zihua Hu. Email zihuahu@ Published 5 December 2007 Genome Biology 2007 8 R257 doi gb-2007-8- l2-r257 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2007 8 12 R257 Received 28 May 2007 Revised 19 October 2007 Accepted 5 December 2007 2007 Hu et al. licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Background Previous methods employed for the identification of synergistic transcription factors TFs are based on either TF enrichment from co-regulated genes or phylogenetic footprinting. Despite the success of these methods both have limitations. Results We propose a new strategy to identify synergistic TFs by function conservation. Rather than aligning the regulatory sequences from orthologous genes and then identifying conserved TF binding sites TFBSs in the alignment we developed computational approaches to implement the novel strategy. These methods include combinatorial TFBS enrichment utilizing distance constraints followed by enrichment of overlapping orthologous genes from human and mouse whose regulatory sequences contain the enriched TFBS combinations. Subsequently integration of function .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.