TAILIEUCHUNG - Báo cáo khoa học: "A case for a CUG-initiated coding sequence overlapping torovirus ORF1a and encoding a novel 30 kDa product"

A case for a CUG-initiated coding sequence overlapping torovirus ORF1a and encoding a novel 30 kDa product | Virology Journal BioMed Central Open Access Short report A case for a CUG-initiated coding sequence overlapping torovirus ORFIa and encoding a novel 30 kDa product Andrew E Firth 1 and John F Atkins 1 2 Address 1BioSciences Institute University College Cork Cork Ireland and 2Department of Human Genetics University of Utah Salt Lake City UT 84112-5330 USA Email Andrew E Firth - John F Atkins - Corresponding authors Published 8 September 2009 Received 9 August 2009 Accepted 8 September 2009 Virologyjournal 2009 6 136 doi 1743-422X-6-136 This article is available from http content 6 1 136 2009 Firth and Atkins licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract The genus Torovirus order Nidovirales includes a number of species that infect livestock. These viruses have a linear positive-sense ssRNA genome of 25-30 kb encoding a large polyprotein that is expressed from the genomic RNA and several additional proteins expressed from a nested set of 3 -coterminal subgenomic RNAs. In this brief report we describe the bioinformatic discovery of a new apparently coding ORF that overlaps the 5 end of the polyprotein coding sequence ORFIa in the 2 reading frame. The new ORF has a strong coding signature and in fact is more conserved at the amino acid level than the overlapping region of ORF1a. We propose that the new ORF utilizes a non-AUG initiation codon - namely a conserved CUG codon in a strong Kozak context - upstream of the ORF1a AUG initiation codon resulting in a novel 258 amino acid protein dubbed 30K . Findings The genus Torovirus belongs to the family Coronaviridae in the order Nidovirales. Species include Bovine torovirus Equine torovirus and Porcine torovirus. As

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.