Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo khoa học: Seed-based systematic discovery of specific transcription factor target genes
TAILIEUCHUNG - Báo cáo khoa học: Seed-based systematic discovery of specific transcription factor target genes
Reliable prediction of specific transcription factor target genes is a major challenge in systems biology and functional genomics. Current sequence-based methods yield many false predictions, due to the short and degenerated DNA-binding motifs. | ễFEBS Journal Seed-based systematic discovery of specific transcription factor target genes Ralf Mrowka1 2 3 Nils Bluthgen4 and Michael Fahling1 3 1 Paul-Ehrlich-Zentrum fur Experimentelle Medizin Berlin Germany 2 AG Systems Biology - ComputationalPhysiology Berlin Germany 3 Johannes-Muller-Institut fur Physiologie Charite-Universitatsmedizin Berlin Germany 4 Schoolof ChemicalEngineering and AnalyticalSciences Manchester Interdisciplinary Biocentre University of Manchester UK Keywords feedback glaucoma NF-kB optineurin transcription factor target prediction Correspondence R. Mrowka Paul-Ehrlich-Zentrum fur Experimentelle Medizin AG Systems Biology - ComputationalPhysiology Tucholskystr. 2 D-10117 Berlin Germany Fax 49 30 450528972 Tel 49 30 450528218 E-mail Received 26 February 2008 revised 1 April 2008 accepted 16 April 2008 doi Reliable prediction of specific transcription factor target genes is a major challenge in systems biology and functional genomics. Current sequence-based methods yield many false predictions due to the short and degenerated DNA-binding motifs. Here we describe a new systematic genome-wide approach the seed-distribution-distance method that searches large-scale genome-wide expression data for genes that are similarly expressed as known targets. This method is used to identify genes that are likely targets allowing sequence-based methods to focus on a subset of genes giving rise to fewer false-positive predictions. We show by cross-validation that this method is robust in recovering specific target genes. Furthermore this method identifies genes with typical functions and binding motifs of the seed. The method is illustrated by predicting novel targets of the transcription factor nuclear factor kappaB NF-kB . Among the new targets is optineurin which plays a key role in the pathogenesis of acquired blindness caused by adult-onset primary open-angle glaucoma. We show experimentally that
Thanh Tuấn
53
15
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học: From functional genomics to systems biology Meeting report based on the presentations at the 3rd EMBL Biennial Symposium 2006 (Heidelberg, Germany) Sergii Ivakhno
10
85
0
Báo cáo khoa học: It is all about resolution Meeting report based upon presentations at the 10th International Global BioMillennium 2006 symposium on molecular cell biology (Tbilisi, Georgia)
4
60
0
Báo cáo khoa học: Serpins 2005 – fun between theb-sheets Meeting report based upon presentations made at the 4th Interna-tional Symposium on Serpin Structure, Function and Biology (Cairns, Australia)
6
59
0
Báo cáo khoa học: Acetylcholinesterase in cell adhesion, neurite growth and network formation
7
91
0
Báo cáo khoa học: Characterization of Mycobacterium tuberculosis nicotinamidase/pyrazinamidase
10
62
0
Báo cáo khoa học: The relative contribution of mannose salvage pathways to glycosylation in PMI-deficient mouse embryonic fibroblast cells
11
54
0
Báo cáo khoa học: Schizosaccharomyces pombe positive cofactor 4 stimulates basal transcription from TATA-containing and TATA-less promoters through Mediator and transcription factor IIA
11
88
0
Báo cáo khoa học về: INVITED LECTURES
61
85
0
Báo cáo khoa học: Intermittent hypoxia is a key regulator of cancer cell and endothelial cell interplay in tumours
12
86
0
Báo cáo khoa học: Hexameric ring structure of the N-terminal domain of Mycobacterium tuberculosis DnaB helicase
8
85
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461742
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22075
54
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10740
524
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
9929
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9427
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8134
1122
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8134
421
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7819
2212
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6502
247
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5680
81
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Report medicine
traditional medicine
scientific reports
molecular Biology
tumor cells
Antimicrobial
medical knowledge
medical research
analysis of cytoplasmic
oxidation
Crystal structure
bacteria
hemoglobin
medicine
cell proliferation
breast cancer
chemical reaction
gastric cancer
hormone medicine
biochemical studies
environmental medicine
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Giáo án mầm non chương trình đổi mới: Gia đình vui nhộn
4
300
1
29-03-2024
Coherence and Ultrashort Pulse Laser Emission Part 9
40
237
0
29-03-2024
Động cơ đốt trong và máy kéo công nghiêp tập 2 part 8
32
250
0
29-03-2024
Sẵn sàng cho thảm họa
9
210
0
29-03-2024
beginning Ubuntu Linux phần 1
34
199
1
29-03-2024
Anh văn bằng C-124
8
162
0
29-03-2024
Magnetic Bearings Theory and Applications phần 2
14
159
0
29-03-2024
Getting StartED with Windows 7 phần 5
42
171
1
29-03-2024
Báo cáo nghiên cứu khoa học " KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU BƯỚC ĐẦU VỀ THIÊN ĐỊCH CHÂN KHỚP TRÊN CÂY THANH TRÀ Ở THỪA THIÊN HUẾ "
7
164
0
29-03-2024
Posted prices versus bargaining in markets_7
23
147
0
29-03-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7819
2212
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3652
1219
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5130
1173
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8134
1122
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5037
1084
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3403
638
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3620
524
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10740
524
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
3901
502
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4027
470
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.