TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Prediction of prognostic biomarkers for Interferon-based therapy to Hepatitis C Virus patients: a metaanalysis of the NS5A protein in subtypes 1a, 1b, and 3a"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Prediction of prognostic biomarkers for Interferon-based therapy to Hepatitis C Virus patients: a metaanalysis of the NS5A protein in subtypes 1a, 1b, and 3a | ElHefnawi et al. Virology Journal 2010 7 130 http content 7 1 130 VIROLOGY JOURNAL RESEARCH Open Access Prediction of prognostic biomarkers for Interferon-based therapy to Hepatitis C Virus patients a metaanalysis of the NS5A protein in subtypes 1a 1b and 3a Mahmoud M ElHefnawi 1 2 Suher Zada3 and Iman A El-Azab4 Abstract Background Hepatitis C virus HCV is a worldwide health problem with no vaccine and the only approved therapy is Interferon-based plus Ribavarin. Response prediction to treatment has health and economic impacts and is a multifactorial problem including both host and viral factors age sex ethnicity pre-treatment viral load and dynamics of the HCV non-structural protein NS5A quasispecies . We implement a novel approach for extracting features including informative markers from mutations in the non-structural 5A protein NS5A specifically its Interferon sensitivity determining region ISDR and V3 regions and use a novel bioinformatics approach for pattern recognition on the NS5A protein and its motifs to find biomarkers for response prediction using class association rules and comparing the predictability of the different features. Results A total of 58 sequences from sustained responders and 94 from non-responders were downloaded from the HCV LANL database. Site-specific signatures for response prediction from the NS5A protein were extracted from the alignments. Class association rules were generated . sustained response is associated with position A2368T in subtype 1a support 100 and confidence in subtype 1b response is associated with E2356G D K support and confidence . Conclusion The V3 region was a more accurate biomarker than the ISDR region. Subtype-specific class association rules gave better support and confidence than profile hidden Markov models HMMs scores genetic distances or number of variable sites and would thus aid in the prediction of prognostic biomarkers and improve the accuracy of prognosis.

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.