TAILIEUCHUNG - A phylogenomic study of the genus Alphavirus employing whole genome comparison

Phân tích phát sinh chủng loài đối với nhóm Aplhavirus đã được thực hiện từ lâu trước đây bằng cách sử dụng một đoạn gene nào đó, hoặc cả một gene hoặc một phần dữ liệu proteomics. Trên tờ Comaparative and Functional Genomics 6 ,nhóm tác giả Luers và cộng sự đã sử dụng trình tự cDNA và protein từ ngân hàng dữ liệu GenBank để phân tích quá trình tiến hóa của nhóm virus này. | A phylogenomic study of the genus Alphavirus employing whole genome comparison Phân tích phát sinh chủng loài đối với nhóm Aplhavirus đã được thực hiện từ lâu trước đây bằng cách sử dụng một đoạn gene nào đó hoặc cả một gene hoặc một phần dữ liệu proteomics. Trên tờ Comaparative and Functional Genomics 6 217-227 xem bài báo đính kèm nhóm tác giả Luers và cộng sự đã sử dụng trình tự cDNA và protein từ ngân hàng dữ liệu GenBank để phân tích quá trình tiến hóa của nhóm virus này. Dữ liệu dùng cho phân tích phần lớn là các gene đã được giải trình tự có chiều dài đầy đủ chỉ một số rất ít là đoạn gene chưa hoàn chỉnh. Quá trình phát sinh chủng loài của nhóm alphavirus được suy luận từ 3 phép phân tích riêng rẽ là 1 phân tích vùng mã hóa cấu trúc vỏ capsid 2 phân tích vùng mã hóa không cấu trúc và 3 phân tích toàn bộ genome thông qua phương pháp khoảng cách lân cận distance neighbour-joining . Kết quả phân tích trong nghiên cứu này đã xác nhận lại rằng nhánh Western Equine Ecepphalitis WEE là do quá trình tái tổ hợp mà ra cũng như đồng ý với nhiều công bố trước đó cho rằng việc phát xạ loài theo quy mô địa lý và sự phân kỳ của các nhóm khác nhau là do các cơ chế khác nhau. Dữ liệu phân tích của nhóm Luers cho thấy hai nhánh Salmon Pancreatic Disease Virus và Sleeping Disease Virus là một nhánh có chung một thủy tổ .

Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.