TAILIEUCHUNG - Ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS vào phân tích tự động dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn

Bài viết Ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS vào phân tích tự động dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn nghiên cứu kết quả bước đầu ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS trong phân tích tự động hệ gen của vi khuẩn kháng kháng sinh. | TẠP CHÍ Y DƯỢC LÂM SÀNG 108 Tập 17 - Số 5 2022 DOI Ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS vào phân tích tự động dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn Application of AMROMICS bioinformatics tool to automatic analysis of bacterial whole genome sequencing data Nguyễn Thị Ngọc Anh Hoàng Thu Trang Viện NC Y Dược học QS Học viện Quân y Lê Phương Thảo Quyên Trần Tiến Mạnh Đại học KHTN Đại học Quốc gia Hà Nội Trần Trung Kiên Bùi Đức Nam Học viện Quân y Hoàng Nhật Đức Hồ Hữu Thọ Bệnh viện Quân y 103 Tóm tắt Mục tiêu Nghiên cứu kết quả bước đầu ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS trong phân tích tự động hệ gen của vi khuẩn kháng kháng sinh. Đối tượng và phương pháp Phân tích toàn bộ hệ gen của 14 chủng vi khuẩn E. coli và chủng E. coli K-12 MG1655 được công bố trên cơ sở dữ liệu NCBI bằng công cụ tin sinh AMROMICS. Kết quả Công cụ tự động phân tích toàn bộ hệ gen của 15 mẫu vi khuẩn trong thời gian ngắn cùng lúc đưa ra kết quả về cấu trúc hệ gen kiểu trình tự gen độc lực gen kháng với giao diện đơn giản và dễ sử dụng. Đa số các chủng nghiên cứu có thể là vi khuẩn đa kháng và mang gen kháng với các kháng sinh thông dụng như quinolone và aminoglycoside. Kết luận Công cụ AMROMICS có tiềm năng ứng dụng trong lâm sàng để nhanh chóng xác định gen kháng kháng sinh và gen độc lực của vi khuẩn trên cơ sở đó có thể ứng dụng trong điều trị và kiểm soát nhiễm khuẩn hiệu quả. Từ khóa AMROMICS phân tích giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn kháng kháng sinh. Summary Objective To investigate initially the application of the AMROMICS bioinformatics tool in the automatic analysis of bacterial genomes. Subject and method Whole-genome analysis of 14 E. coli isolates and the standard E. coli K-12 MG1655 strain published on NCBI database using the AMROMICS bioinformatics tool. Result AMROMICS automatically analyzed the entire genome of 15 bacterial samples in a short time and simultaneously showed genome structure sequence type virulence gene and resistance gene with a simple and easy-to-use

• Y khoa - Dược
• Nghiên cứu y học
• Toàn bộ hệ gen
• Kháng kháng sinh
• Công cụ tin sinh AMROMICS
• Cấu trúc hệ gen
• Gen độc lực
• Nghiên cứu trong khoa học sức khỏe
• Thiết kế nghiên cứu Y học
• Loại thiết kế trong nghiên cứu Y học
• Thành phần thiết kế nghiên cứu Y học
• Triển khai thiết kế nghiên cứu Y học
• Quy trìnhthiết kế nghiên cứu Y học
• Ebook Phương pháp nghiên cứu y học
• Phương pháp nghiên cứu y học
• Phương pháp nghiên cứu
• Báo cáo khoa học
• Vấn đề nghiên cứu y học
• Bài giảng Phương pháp nghiên cứu khoa học
• Phương pháp nghiên cứu khoa học
• Đề cương nghiên cứu
• Phương pháp nghiên cứu khoa học y học
• Nghiên cứu khoa học y học
• Mẫu trong nghiên cứu y học
• Cỡ mẫu trong nghiên cứu y học
• Công thức tính cỡ mẫu y học
• Phương pháp chọn mẫu cơ bản trong y học
• Đạo đức trong nghiên cứu Y học
• Bài giảng Đạo đức trong nghiên cứu Y
• Đạo đức Y học
• Lịch sử đạo đức nghiên cứu
• Nguyên tắc đạo đức nghiên cứu
• Thỏa thuận tham gia nghiên cứu
• Đề tài y tế đảm bảo an toàn người bệnh
• Đề tài nghiên cứu khoa học y khoa
• Đề tài nghiên cứu khoa học
• Nghiên cứu khoa học
• Báo cáo nghiên cứu khoa học
• Nghiên cứu y sinh học
• Nguyên tắc cơ bản của đạo đức
• Hội đồng đạo đức nghiên cứu
• Bài giảng Nghiên cứu khoa học
• Kế hoạch nghiên cứu khoa học
• Các bước nghiên cứu khoa học
• Tiến hành nghiên cứu khoa học
• Các loại nghiên cứu khoa học
• Thiết kế nghiên cứu khoa học
• Mục lục bài viết Tạp chí nghiên cứu Y học
• Mục lục bài viết
• Tạp chí nghiên cứu Y học
• Tạp chí Y học
• Báo cáo xây dựng hệ thống y tế
• Nghiên cứu viên
• Nghiên cứu viên chính
• Trách nhiệm của nghiên cứu viên chính
• Chuyên môn của nghiên cứu viên
• Phương pháp chọn mẫu
• Nghiên cứu Dịch tễ học
• Nhân học y tế ứng dụng
• Nhân học y tế
• Bài giảng nhân học y tế
• Y tế công cộng
• Nghiên cứu định tính
• y học phổ thông
• y học thực hành
• kiến thức y học
• chuyên ngành y học
• tài liệu y học
• chuyên ngành y khoa
• bệnh thường gặp
• Trung y học khái luận
• Y học phương Đông
• Nghiên cứu Đông y
• Nghiên cứu Trung y
• Sách Đông y
• Y học cổ truyền
• Đề tài nghiên cứu
• Chuyên ngành y dược
• Danh mục đề tài
• Y khoa trẻ em
• Khoa học y khoa trẻ em
• Cách viết đề tài nghiên cứu khoa học
• y học dân tộc
• Khoa học môi trường
• Phương pháp nghiên cứu khoa học môi trường
• Phát triển kế hoạch nghiên cứu
• Hình thành ý tưởng nghiên cứu
• Nội dung hình thành ý tưởng
• Định hướng nghiên cứu
• Tạp chí Y Dược học
• Bài viết về y học
• Đại học Y dược Huế
• Hoạt động nghiên cứu khoa học sức khỏe
• giáo trình y học
• cẩm nang đông y
• chẩn trị đông y
• học thuyết đông y
• phép dưỡng sinh
• phương huyệt trị bệnh