TAILIEUCHUNG - Phân tích in-silico xác định và mô tả họ gen kháng NBS-LRR ở chuối Musa acuminata

Bệnh hại do vi khuẩn, virus là mối đe dọa nghiêm trọng đối với ngành sản xuất chuối trên thế giới nói chung, Việt Nam nói riêng. Ngoài các biện pháp canh tác, việc khai thác và ứng dụng nguồn gen kháng - phần lớn thuộc họ gen NBS-LRR (Nucleotide binding site - Leucine rich repeat) trong chọn tạo, cải thiện giống chuối là phương thức bền vững để đối phó với dịch bệnh. Hệ gen loài chuối Musa acuminata được giải mã tạo tiền đề cho các nghiên cứu di truyền chuyên sâu, bao gồm xác định họ gen kháng NBS-LRR. | Khoa học Nông nghiệp DOI 12 .52-58 Phân tích in-silico xác định và mô tả họ gen kháng NBS-LRR ở chuối Musa acuminata Trần Đức Trung Tạ Hồng Lĩnh Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam Ngày nhận bài 1 9 2021 ngày chuyển phản biện 6 9 2021 ngày nhận phản biện 7 10 2021 ngày chấp nhận đăng 12 10 2021 Tóm tắt Bệnh hại do vi khuẩn virus là mối đe dọa nghiêm trọng đối với ngành sản xuất chuối trên thế giới nói chung Việt Nam nói riêng. Ngoài các biện pháp canh tác việc khai thác và ứng dụng nguồn gen kháng - phần lớn thuộc họ gen NBS-LRR Nucleotide binding site - Leucine rich repeat trong chọn tạo cải thiện giống chuối là phương thức bền vững để đối phó với dịch bệnh. Hệ gen loài chuối Musa acuminata được giải mã tạo tiền đề cho các nghiên cứu di truyền chuyên sâu bao gồm xác định họ gen kháng NBS-LRR. Trong nghiên cứu này các công cụ tin sinh học đã được sử dụng để xác định mô tả cấu trúc và quá trình tiến hóa của 97 gen NBS-LRR. Ngoại trừ gen Ma_NBS_083 thuộc phân họ RNL các gen kháng còn lại ở chuối M. acuminata thuộc phân họ CNL và hầu hết là gen chứa một exon. 66 gen NBS-LRR 68 được định vị trên 11 nhiễm sắc thể NST 38 gen trong số đó 39 hình thành các cụm gen. Các gen NBS-LRR của chuối được chia thành 7 phân nhóm dựa trên sự đa dạng về trình tự và số lượng cấu trúc các motif bảo thủ đặc trưng cho các vùng chức năng. Kết quả này cung cấp cơ sở khoa học cho các nghiên cứu đánh giá biểu hiện gen kháng và khai thác ứng dụng trong chọn tạo giống chuối. Từ khóa cây phát sinh gen kháng NBS-LRR MEME motif Musa acuminata phân tích in-silico tiến hóa. Chỉ số phân loại Giới thiệu thể tương tự là Toll interleukin-1 Toll interleukin 1 receptor like - TIR vùng xoắn kép Coiled coil - CC hoặc vùng Trải qua quá trình tiến hóa với mối tương tác biến động kháng bệnh phấn trắng số 8 Resistance to powdery mildew liên tục từ các tác nhân gây bệnh virus vi khuẩn nấm 8 - RPW8 4 . Theo đó các phân họ được định danh là TIR- sâu bệnh giới thực vật đã kiến tạo hệ thống miễn

• Nông nghiệp
• Cây phát sinh
• Gen kháng NBS LRR
• Phân tích in silico
• Hệ gen loài chuối Musa acuminata
• Bệnh hại do vi khuẩn
• Biện pháp điều khiển cây ăn trái
• Cây ăn trái
• Điều khiển ra hoa cây ăn trái
• Điều khiển sinh trưởng cây ăn trái
• Điều khiển phát triển cây ăn trái
• Nhân giống cây cát tường
• Eustoma Grandiflorum
• Phát sinh phôi sinh dưỡng
• Phát sinh cơ quan
• Phương thức nhân giống
• Sinh sản vô tính
• Luận văn Thạc sĩ Sinh học
• Cây cam đường
• Nghiên cứu cây cam đường
• Đặc điểm sinh vật học cây cam đường
• Giải phẫu cây cam đường
• Sự phát triển của cây cam đường
• Ảnh hưởng của nồng độ chì
• Nồng độ chì đến sinh trưởng
• Sinh trưởng cây phát tài
• Tích lũy chì của cây phát tài
• Loại bỏ chì của cây phát tài
• Tình hình sinh trưởng và phát triển của cây ba kích
• Sinh trưởng của cây ba kích
• Kết quả tình hình sâu bệnh hại cây ba kích
• Thử nghiệm cây ba kích dưới tán cây cao su
• Xã Hòa Trạch
• Huyện Bố Trạch
• Cây ba kích
• Sự hình thành mô sẹo
• Mô sẹo phát sinh
• Cây con từ nuôi cấy đỉnh
• Sinh trưởng giống địa lan lai vàng hoàng hậu
• Vi sinh vật nội sinh
• Cây hồ tiêu
• Vi sinh vật kháng nấm
• An toàn sinh học
• Phát triển cây hồ tiêu
• Thời vụ gieo trồng cây Sachi
• Sinh trưởng cây Sachi
• Năng suất cây Sachi
• Phát triển cây Sachi
• Giống cây dược liệu mới
• Đánh giá khả năng sinh trưởng cây lá gai
• Phát triển của cây lá gai
• Cây lá gai
• Cây lá gai ở vườn sản xuất
• Năng suất cây lá gai
• Vai trò của Auxin
• Hình thái chồi in vitro
• Phát sinh hình thái chồi in vitro
• Cây đậu Vigna Angularis
• Mô phân sinh ngọn cây đậu Vigna Angularis
• Mật độ đến sinh trưởng cây sa nhân tím
• Cây sa nhân tím
• Năng suất cây sa nhân tím
• Chất lượng dược liệu cây sa nhân tím
• Đặc điểm nông sinh học
• Hình thái rễ bất định In Vitro
• Sự phát sinh hình thái rễ bất định
• Khúc cắt thân cây đậu Vigna Angularis
• Cách tạo cây In Vitro
• Nuôi cấy hạt cây In Vitro
• Tài liệu Cây ngô
• Đặc điểm cây ngô
• Sự sinh trưởng của cây ngô
• Sự phát triển của cây ngô
• Điều kiện sinh thái cây ngô
• Chăm sóc cây ngô
• Chất điều hòa sinh trưởng
• Sự phát sinh chồi
• Sự phát sinh rễ
• Cây gừng đen
• Nuôi cấy mô
• Than sinh học
• Độ ẩm đất
• Phân hữu cơ
• Mức sinh trưởng của cây rau
• Năng suất sinh học của cây rau cải bắp
• Năng suất sinh học của cây rau cải bẹ xanh
• Tóm tắt luận văn Thạc sĩ Khoa học
• Sinh thái học
• Dinh dưỡng khoáng
• Sinh trưởng cây ngô
• Phát triển của cây ngô
• Điều kiện sinh thái đất nhiễm mặn
• Tỉnh Quảng Nam
• Cây bá bệnh
• Hình thái khối mô sẹo bá bệnh
• Phát sinh hình thái của mô sẹo cây bá bệnh
• Môi trường thích hợp cho sự tăng sinh mô sẹo
• Khối lượng mẫu cấy mô sẹo
• Số lượng rễ hình thành từ mô sẹo bá bệnh
• Mô sẹo bá bệnh
• Phép phân tích hệ thống cây phát sinh loài
• Phân tích hệ thống cây phát sinh loài
• Tin sinh học
• Công nghệ sinh học
• Ứng dụng công nghệ sinh học
• Bài giảng tin sinh học chương 4
• Bài giảng Sinh học 7
• Cây phát sinh giới động vật
• Sinh sản hữu tính
• Hình thức sinh sản
• Nhân giống in vitro
• Chiều cao cây Giảo cổ lam
• Chiều dài rễ của cây Giảo cổ lam
• Cây Giảo cổ lam
• Sinh trưởng phát triển của cây Giảo cổ lam
• Gynostemma pubescens
• Sinh trưởng phát triển của cây đinh lăng
• Kĩ thuật cắt tỉa cây đinh lăng
• Giới thiệu chung về cây đinh lăng
• Nghiên cứu về cây đinh lăng
• Cắt tỉa đến chỉ số SPAD của lá đinh lăng
• Giai đoạn phát triển của cây sú
• Cơ quan sinh sản của cây sú
• Cây sú Aegiceras Corniculatum L Blanco
• Cây sú mọc tự nhiên ở ven bờ biển
• Chụp ảnh hiển vi các tiêu bản
• Phương pháp nhân giống vô tính
• Khả năng sinh trưởng cây Thạch đen
• Phát triển cây Thạch đen
• Tỷ lệ sống của cây Thạch đen
• Thời vụ trồng cây Thạch đen