TAILIEUCHUNG - Lắp ráp và chú giải hệ gen tôm thẻ chân trắng (litopenaeus vannamei) bị nhiễm virus đốm trắng ở Việt Nam

Nội dung bài viết trình bày dữ liệu hệ gen của tôm thẻ chân trắng nhiễm virus đốm trắng được lắp ráp bằng công cụ SOAPdenovo2 thu được hệ gen có kích thước khoảng 1,67Gb với scaffold với N50 là 616 bp, từ đó dự đoán được gen. Trong đó có gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu UniProtKB/Swissprot và gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu NT. Đây là những kết quả ban đầu có ý nghĩa quan trọng cho các nghiên cứu tiếp theo về tính trạng kháng bệnh virus đốm trắng của tôm thẻ chân trắng ở Việt Nam. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 19 2 271-277 2021 LẮP RÁP VÀ CHÚ GIẢI HỆ GEN TÔM THẺ CHÂN TRẮNG LITOPENAEUS VANNAMEI BỊ NHIỄM VIRUS ĐỐM TRẮNG Ở VIỆT NAM Nguyễn Văn Tụng1 Nguyễn Thị Kim Liên1 Dương Chí Thành1 Nguyễn Thu Hiền1 Nguyễn Ngọc Lan1 Nguyễn Thị Thanh Ngân1 Nguyễn Huy Hoàng1 Trịnh Thị Trang2 Nguyễn Hữu Ninh3 Nguyễn Hữu Hùng3 1 Viện Nghiên cứu hệ gen Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 2 Học viện Nông nghiệp Việt Nam Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn 3 Viện Nghiên cứu Nuôi trồng thủy sản 3 Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail ntkimlienibt@ Ngày nhận bài Ngày nhận đăng TÓM TẮT Tôm thẻ chân trắng Thái Bình Dương Penaeus vannamei hoặc Litopenaeus vannamei là loài tôm có nguồn gốc từ Nam Mỹ đang là một trong những đối tượng tôm nuôi quan trọng có giá trị kinh tế cao ở Việt Nam và nhiều nơi trên thế giới. Trong hai thập kỷ gần đây bệnh do virus đốm trắng white spot syndrome virus - WSSV gây ra ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành nuôi tôm với tỷ lệ gây chết có thể lên đến 100 sau 3 đến 10 ngày phát bệnh. Giải trình tự và lắp ráp hệ gen là một bước quan trọng để cung cấp thông tin di truyền và nghiên cứu các cơ chế phân tử ở các loài có giá trị kinh tế cao. Do đó nghiên cứu này tiến hành giải trình tự lắp ráp và chú giải hệ gen của tôm thẻ chân trắng nhiễm virus đốm trắng tại Việt Nam. Dữ liệu hệ gen của tôm thẻ chân trắng nhiễm virus đốm trắng được lắp ráp bằng công cụ SOAPdenovo2 thu được hệ gen có kích thước khoảng 1 67Gb với scaffold với N50 là 616 bp từ đó dự đoán được gen. Trong đó có gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu UniProtKB Swissprot và gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu NT. Đây là những kết quả ban đầu có ý nghĩa quan trọng cho các nghiên cứu tiếp theo về tính trạng kháng bệnh virus đốm trắng của tôm thẻ chân trắng ở Việt Nam. Từ khóa lắp ráp de novo Litopenaeus vannamei SOAP denovo2 tôm thẻ chân trắng virus đốm trắng ĐẶT VẤN ĐỀ với các mô

• Sinh học
• Công nghệ sinh học
• Lắp ráp gen tôm thẻ
• Hệ gen tôm thẻ chân trắng
• Bệnh nhiễm virus đốm trắng
• SOAP denovo2
• Lắp ráp de novo
• Bài giảng Công nghệ sinh học
• Ứng dụng của công nghệ sinh học
• Phương pháp công nghệ sinh học
• Công nghệ sinh học động vật
• Công nghệ sinh học người
• Công nghệ sinh học y sinh
• Sinh học phân tử
• Sinh học tế bào
• Vai trò của công nghệ sinh học
• Sự phát triển của sinh học phân tử
• Cơ sở của công nghệ sinh học
• Giáo trình Công nghệ sinh học
• Tài liệu Công nghệ sinh học
• Nhập môn công nghệ Sinh học
• Công nghệ sinh học phân tử
• Công nghệ sinh học vi sinh vật
• Công nghệ sinh học thực vật
• Công nghệ sinh học môi trường
• Bài giảng Công nghệ sinh học môi trường
• Công nghệ sinh học môi trường chương 7
• Công nghệ sinh học trong nông nghiệp
• Khoa học tự nhiên
• Đề cương môn học
• Định nghĩa công nghệ sinh học
• Lịch sử công nghệ sinh học
• Kinh tế công nghệ sinh học
• Pháp lý công nghệ sinh học
• Công nghệ sinh học y tế
• Công nghệ sinh học nông nghiệp
• Đề cương Công nghệ sinh học
• Ôn tập Công nghệ sinh học
• Ôn thi Công nghệ sinh học
• Bài tập Công nghệ sinh học
• Kiến thức Công nghệ sinh học
• Chẩn đoán phân tử
• công nghệ thực phẩm
• phản ứng khuếch đại gen
• nghiên cứu Công nghệ sinh học
• thiết bị công nghệ sinh học
• sinh học
• Công nghệ sinh học môi trường chương 5
• Chất đốt sinh học
• Năng lượng và chất đốt sinh học
• Sinh học môi trường
• Công nghệ sinh học môi trường chương 3
• Công nghệ sạch
• Chất thải sinh hoạt
• Bài giảng Công nghệ sinh học thực phẩm
• Công nghệ sinh học thực phẩm
• Tài liệu Công nghệ sinh học thực phẩm
• Tìm hiểu công nghệ sinh học thực phẩm