Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Công Nghệ Thông Tin
Kỹ thuật lập trình
Một thuật toán tìm các Biclusters trong dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian dựa trên cây hậu tố
TAILIEUCHUNG - Một thuật toán tìm các Biclusters trong dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian dựa trên cây hậu tố
Trong bài báo này, chúng tôi trình bày một hướng tiếp cận mới dựa trên các thuật toán biclustering (phân cụm hai chiều) để tìm các mẫu quan trọng từ lượng lớn dữ liệu biểu hiện gen. Cụ thể, chúng tôi giới thiệu thuật toán dựa trên cây hậu tố CCC-biclustering, sau đó thực nghiệm trên hai tập dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian. | JOURNAL OF SCIENCE OF HNUE FIT. 2013 Vol. 58 pp. 47-59 This paper is available online at http MỘT THUẬT TOÁN TÌM CÁC BICLUSTERS TRONG DỮ LIỆU BIỂU HIỆN GEN THEO THỜI GIAN DỰA TRÊN CÂY HẬU TỐ Nguyễn Văn Trung1 Đỗ Văn Dư2 và Trần Đăng Hưng3 1 Trường Cao đẳng Y tế Lạng Sơn 2 Trường Cao đẳng Sư phạm Nam Định 3 Khoa Công nghệ Thông tin Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 3 Email hungtd@ Tóm tắt. Phân tích dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian là một trong những thao tác quan trọng để tìm ra chức năng của các phần tử sinh học. Với lượng dữ liệu ngày càng nhiều các phương pháp thống kê cổ điển không còn phù hợp. Điều này đòi hỏi phải phát triển các phương pháp tính toán mới để phân tích hiệu quả các nguồn dữ liệu biểu hiện gen. Trong bài báo này chúng tôi trình bày một hướng tiếp cận mới dựa trên các thuật toán biclustering phân cụm hai chiều để tìm các mẫu quan trọng từ lượng lớn dữ liệu biểu hiện gen. Cụ thể chúng tôi giới thiệu thuật toán dựa trên cây hậu tố CCC-biclustering sau đó thực nghiệm trên hai tập dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian. Kết quả cho thấy các mẫu tìm được có độ biểu hiện tương đồng cao từ các mẫu này có thể dự đoán hoặc tiên lượng các chức năng mới cho các phần tử sinh học. Từ khóa Bicluster dữ liệu biểu hiện gen cây hậu tố 1. Mở Đầu Việc phân tích dữ liệu biểu hiện gen mà cụ thể là phân nhóm các gen có sự biểu hiện giống nhau trong từng thời điểm thành các cụm cluster được thực hiện bởi các thuật toán phân cụm clustering . Các thuật toán này thường tìm cách nhóm các gen có sự biểu hiện phụ thuộc nhau trên toàn bộ các điều kiện thí nghiệm. Tuy nhiên trên thực tế các gen thường chỉ thể hiện phụ thuộc với nhau trên một số điều kiện nào đó và độc lập với nhau trong điều kiện khác. Điều này dẫn đến một hạn chế rất lớn của các thuật toán clustering là không thể tìm ra được các gen chỉ thể hiện giống nhau trên một số điều kiện thí nghiệm. Để khắc phục hạn chế này người ta đã đề xuất một phương pháp phân cụm mới có tên là .
Bảo Lan
84
13
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Nghiên cứu phát triển dữ liệu lớn về hệ gen sinh vật và định hướng ứng dụng
18
71
2
Một thuật toán tìm các Biclusters trong dữ liệu biểu hiện gen theo thời gian dựa trên cây hậu tố
13
69
1
Nghiên cứu biểu hiện gen eg9 mã hóa Endoglucanase gh8 có nguồn gốc từ dữ liệu giải trình tự DNA đa hệ gen của vi khuẩn trong mùn xung quanh nấm mục trắng thủy phân gỗ trong tế bào Escherichia coli
6
48
1
Thiết kế Probe để khai thác gen mã hóa Pectinesterase từ dữ liệu giải trình tự dna Metagenome và đồng biểu hiện gen Gpecs1 của vi khuẩn trong dạ cỏ của dê với chaperone PG KJE8 trong Escherichia coli
8
88
0
Thiết kế probe để khai thác gen mã hóa pectinesterase từ dữ liệu giải trình tự DNA metagenome và đồng biểu hiện gen GPECS1 của vi khuẩn trong dạ cỏ của dê với chaperone pG-KJE8 trong Escherichia coli
8
107
0
Phân tích nhóm gen chính đáp ứng với stress hạn và mặn ở cây đậu gà (Cicer arietinum) bằng phân tích dữ liệu giải mã hệ phiên mã
8
45
1
Nâng cao hiệu quả biểu hiện β-glucosidase tái tổ hợp từ trình tự gen trong cơ sở dữ liệu metagenomic suối nước nóng Bình Châu
7
43
1
Phân tích tính bảo thủ trong cấu trúc và khai thác dữ liệu biểu hiện của họ gen mã hóa tiểu phần YA của nhân tố phiên mã NF-Y ở cây rau dền
6
34
1
Tóm tắt luận án Tiến sĩ Công nghệ sinh học: Sàng lọc và biểu hiện gen mã hóa protein ức chế protease của vi sinh vật liên kết hải miên Spheciospongia vesparium thu nhận tại vùng biển Miền Trung, Việt Nam
27
49
1
Luận án Tiến sĩ Công nghệ sinh học: Sàng lọc và biểu hiện gen mã hóa protein ức chế protease của vi sinh vật liên kết hải miên Spheciospongia vesparium thu nhận tại vùng biển Miền Trung, Việt Nam
187
59
1
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461859
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22608
59
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10882
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10055
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9514
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8273
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8225
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7863
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6669
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5766
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Kỹ thuật lập trình
Dữ liệu biểu hiện gen
Cây hậu tố
Thuật toán tìm kiếm
Phân tích dữ liệu
Phần tử sinh học
Thuật toán biclustering
Tập dữ liệu
Công nghệ sinh học
Đa dạng di truyền
Phát triển dữ liệu lớn
Hệ gen sinh vật
Hệ gen biểu hiện
Hệ gen phiên mã
Biểu hiện gen
Khu nấm mục trắng thủy phân gỗ
Giải trình tự DNA metagenome
Quá trình thủy phân cellulose
Glycoside hydrolase họ 8
Thiết kế Probe
Khai thác gen mã hóa Pectinesterase
Gen mã hóa Pectinesterase
Chaperone PG KJE8
Dạ cỏ của dê
Tạp chí sinh học
Academia Journal of Biology
Gen GPECS1
Vi khuẩn trong dạ cỏ của dê
Hệ phiên mã
Cây đậu gà
Gen có biểu hiện đáp ứng
Tin sinh học
Gen đáp ứng stress hạn
Viểu hiện β glucosidase tái tổ hợp
Trình tự gen
Cơ sở dữ liệu metagenomic
Suối nước nóng Bình Châu
Tạp chí Nông nghiệp
Gen mã hóa tiểu phần YA
Nhân tố phiên mã NF Y
Quá trình phát triển cây rau dền
Đặc điểm cấu trúc gen
Luận án Tiến sĩ
Tóm tắt luận án Tiến sĩ
Sàng lọc gen
Vi sinh vật liên kết hải miên
Cơ sở dữ liệu DNA
Luận án Tiến sĩ Sinh học
Tiến sĩ Sinh học
Luận án Sinh học
Di truyền học
Vi sinh vật ruột mối
Dữ liệu DNA đa hệ gen
Mở rộng độ đo
Thông tin tương hỗ có điều kiện
Phương pháp PCA CMI
Phân tích dữ liệu biểu hiện gen
Tái tạo mạng điều khiển gen
Sự chuyển hóa lignocellulose
Hệ vi sinh vật chuyển hóa
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
extremetech Hacking BlackBerry phần 9
31
248
0
25-04-2024
beginning Ubuntu Linux phần 1
34
212
1
25-04-2024
Trading Strategies Profit Making Techniques For Stock_3
23
183
0
25-04-2024
extremetech Hacking Firefox phần 7
46
187
0
25-04-2024
MySQL Basics for Visual Learners PHẦN 9
15
183
0
25-04-2024
Giáo trình CẤU TRÚC DỮ LIỆU VÀ GIẢI THUẬT - Chương 1
5
124
0
25-04-2024
Giáo trình tổng quan khoa học thông tin và thư viện part 7
22
143
2
25-04-2024
New Trends and Developments in Automotive Industry Part 7
35
94
0
25-04-2024
Christmas Meditations on the Twelve Holy Days
173
103
0
25-04-2024
Giáo trình kỹ thuật sữa chữa ô tô, máy nổ part 8
47
137
1
25-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7863
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5688
1350
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3764
1231
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5310
1135
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8273
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3489
642
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10882
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3679
525
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4041
514
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4122
480
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.