TAILIEUCHUNG - Một phương pháp dự đoán gen gây bệnh sử dụng dữ liệu chưa có nhãn

Bài viết trình bày một giải pháp sử dụng các dữ liệu chưa gán nhãn cho bài toán dự đoán gen gây bệnh (gọi tắt là gen bệnh). Thông thường, bài toán dự đoán gen bệnh có thể coi là bài toán phân lớp nhị phân. | Một phương pháp dự đoán gen gây bệnh sử dụng dữ liệu chưa có nhãn JOURNAL OF SCIENCE OF HNUE DOI: Educational Sci., 2015, Vol. 60, No. 7A, pp. 61-69 This paper is available online at MỘT PHƯƠNG PHÁP DỰ ĐOÁN GEN GÂY BỆNH SỬ DỤNG DỮ LIỆU CHƯA CÓ NHÃN 1 Lê Thu Hương 2 Thái Thị Thanh Vân và 3 Trần Đăng Hưng 1 Khoa Tự nhiên, Trường Cao đẳng Sư phạm Điện Biên 2 KhoaCông nghệ Thông tin, Học viện Kỹ thuật Mật mã 3 Khoa Công nghệ Thông tin, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội Tóm tắt. Trong bài báo này, chúng tôi trình bày một giải pháp sử dụng các dữ liệu chưa gán nhãn cho bài toán dự đoán gen gây bệnh (gọi tắt là gen bệnh). Thông thường, bài toán dự đoán gen bệnh có thể coi là bài toán phân lớp nhị phân. Tuy nhiên, trong bài toán này dữ liệu âm tính (negative) thường khó xác định, nên hiệu quả của các phương pháp dự đoán chưa cao. Chúng tôi đã đề xuất một phương án xây dựng tập âm tính bằng cách sử dụng dữ liệu chưa có nhãn để huấn luyện các mô hình học máy nhằm tăng hiệu quả dự đoán. Từ khóa: Dự đoán, gen gây bệnh, dữ liệu chưa có nhãn, phân lớp nhị phân. 1. Mở đầu Từ các nghiên cứu thực nghiệm cho thấy rằng với từng loại bệnh cụ thể, có thể do một số gen quy định gây ra. Tuy nhiên, các nhà thực nghiệm chỉ tìm ra được các gen gây bệnh một cách đơn lẻ trên một số cá thể, hơn nữa các thực nghiệm này rất mất thời gian và chi phí lớn. Khi số lượng dữ liệu sinh học phân tử ngày càng nhiều, các nhà sinh học tính toán có thể đưa ra các phương pháp tính toán dựa trên những gen gây bệnh đã biết để tiên lượng các gen khác. Triết lí chung của các phương pháp tính toán là các gen có quan hệ “gần” với nhau sẽ có khả năng có chung một số chức năng nào đó. Giả sử rằng, ta biết được thông tin quan hệ giữa các gen trong một loài sinh vật thì có thể dự đoán chức năng cho các gen mới. Nhìn từ lĩnh vực khai phá dữ liệu, có thể coi bài toán dự đoán gen gây bệnh là một bài toán phân .

• Sinh học
• Gen gây bệnh
• Dữ liệu chưa có nhãn
• Phân lớp nhị phân
• Mô hình học máy
• Bài toán phân loại gen gây bệnh
• Phát hiện đột biến gen F8
• Dột biến gen F8
• Gen F8 gây bệnh Hemophilia A
• Bệnh Hemophilia A
• Phân tích gen F8
• Phát hiện đột biến gen
• Đột biến gen gây bệnh Alpha Thalassemia
• Bệnh Alpha Thalassemia
• Đột biến gen
• Kỹ thuật Multiplex ARMS PCR
• Bài toán xác định các gen
• Xác định gen gây bệnh
• Lĩnh vực di truyền học
• Nghiên cứu y sinh
• Tìm kiếm gen ứng viên gây bệnh
• Tách dòng gen
• Xác định trình tự gen mã hóa protein
• Xác định trình tự gen
• Mã hóa protein
• Virus gây bệnh xanh lùn
• Tạp chí Tim mạch học Việt Nam
• Bài viết về y học
• Giải trình tự gen toàn bộ vùng mã hóa
• Bệnh cơ tim vô căn
• Bệnh đa gen gây rối loạn
• Bệnh cơ tim phì đại
• Luận án Tiến sĩ
• Luận án Tiến sĩ Y học
• Bệnh nhi Thalassemia
• Đột biến gen gây bệnh Thalassemia
• Đặc điểm dịch tễ học bệnh Thalassemia
• Chỉnh sửa gen
• Em bé chỉnh sửa gen
• Bộ gen của con người
• Đột biến gây bệnh Huntington
• Công cụ kiểm soát gen
• Viết lại chuỗi ADN
• Nghiên cứu y học
• Giải trình tự hệ gen mã hoá
• Loạn sản ngoại bì
• Đột biến gen EDA
• Kỹ thuật giải trình tự hệ gen mã hóa WES
• Bệnh vảy da cá
• Giải trình tự gen đích
• Đột biến mới
• Sừng hóa da
• Gen mã hóa Transglutaminase 1
• Tim mạch học
• Nguyên bào cơ tim
• Loạn nhịp tim
• Gen acyl CoA dehydrogenase
• HOÀN THIỆN QUI TRÌNH PCR ĐA MỒI PHÁT HIỆN ĐỒNG THỜI VI RÚT GÂY BỆNH ĐỐM TRẮNG (White Spot Syndrome Virus) VÀ VI RÚT GÂY BỆNH CÒI (Monodon Baculovirus) Ở TÔM SÚ (Penaeus monodon) CÓ SỬ DỤNG GEN β ACTIN LÀM NỘI CHUẨN
• Phân hạng gen gây bệnh sử dụng học
• tăng Xác suất tiền nghiệm
• K Step Markov
• Phân hạng gen
• Phương pháp phân hạng gen
• Phương pháp phân hạng gen gây bệnh
• Mạng tương tác protein
• Tiểu đường loại 2
• Mô đun bệnh
• Bài toán phân hạng gen dựa trên mạng
• Sàng lọc di truyền tiền làm tổ
• Ngăn ngừa bệnh Thalassemia
• Bệnh lý thiếu máu tán huyết
• Tán huyết di truyền đơn gen
• Bài giảng Đột biến gen
• Bệnh đột biến ở người
• Cơ chế gây đột biến
• Nguyên nhân gây đột biến
• Cấu trúc gen
• Xác định gen Vip3A
• Vi khuẩn Bacillus thuringiensis var kurstaki
• Kỹ thuật sinh học phân tử
• Độc tính gây bệnh
• Côn trùng gây hại
• Phân lập đoạn gen mã hóa
• Biểu hiện đoạn gen mã hóa
• Mã hóa Polypeptit
• Polypeptit giàu tính kháng nguyên
• Kháng nguyên trên Protein
• Virus gây bệnh lúa lùn Sọc Đen
• Tạp chí Khoa học
• Tạp chí sinh học
• Công nghệ sinh học
• Khả năng gây bệnh của nấm đạo ôn
• Khả năng gây bệnh trên cây trồng
• Bệnh đạo ôn
• Nấm gây bệnh đạo ôn
• Bệnh đạo ôn trên lúa
• Đồng bằng sông Cửu Long
• Nấm phân lập gây bệnh đạo ôn lúa
• Phân bố của các gen Avirulence
• Đột biến gen globin
• Đột biến alpha globin
• Bệnh di truyền đơn gen
• Điều trị bệnh Thalassemia
• Luận văn Thạc sĩ Công nghệ sinh học
• Loài sán lá gan lớn
• Hệ gen nhân ribosomal DNA
• Hệ gen DNA ty thể
• Sán lá Trematoda
• Đột biến gen gây tăng đông
• Huyết khối tĩnh mạch mạc treo tràng trên
• Thuốc kháng đông
• Rối loạn tăng đông trên bệnh nhân
• Ứng dụng kỹ thuật PCR
• Ứng dụng kỹ thuật RFLP
• Xác định đột biến gen SMN1
• Bệnh thoái hóa cơ tủy
• Thoái hóa cơ tủy
• Đột biến gen SMN1
• Rối loạn tổng hợp huyết sắc tố
• Bệnh Thalassemia ở trẻ em
• Bệnh nhi α thalassemia