Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Sinh học
Computational approach for selection of epitope-based dengue vaccine targets
TAILIEUCHUNG - Computational approach for selection of epitope-based dengue vaccine targets
In this study, a computational approach was utilized to identify and analyze highly conserved amino acid sequences of the DENV E protein. Sequences of 9 amino acids or more were specifically focused due to their immune-relevant as T-cell determinants. Different bioinformatics tools were responsible for revealing conserved regions in the DENV E protein and constructing the phylogenetic tree from the sequence database. The tools also predicted immunogenicity of the identified vaccine targets. Ultimately, two peptide regions of at least 9 amino acids were chosen due to their high conserved attribute in more than 95% of all collected DENV sequences. | Journal of Biotechnology 14(4): 605-618, 2016 COMPUTATIONAL APPROACH FOR SELECTION OF EPITOPE-BASED DENGUE VACCINE TARGETS Phuc Nguyen1, Ly Le1, 2, * 1 2 International University, Vietnam National University Ho Chi Minh City Ho Chi Minh Institute for Computational Science and Technology * To whom correspondence should be addressed. E-mail: Received: Accepted: SUMMARY High antigenic variability in the envelope (E) protein of different virus strains has been a major obstacle in designing effective vaccines for Dengue virus (DENV). To maintain their biological function, some parts of viral proteins remain stable during evolution thus one possible approach to solve this problem is to recognize specific regions within different protein sequences of E that have the tendency to stay constant through evolution. These regions may possess some special attributes to become a vaccine candidate against dengue virus. In this study, a computational approach was utilized to identify and analyze highly conserved amino acid sequences of the DENV E protein. Sequences of 9 amino acids or more were specifically focused due to their immune-relevant as T-cell determinants. Different bioinformatics tools were responsible for revealing conserved regions in the DENV E protein and constructing the phylogenetic tree from the sequence database. The tools also predicted immunogenicity of the identified vaccine targets. Ultimately, two peptide regions of at least 9 amino acids were chosen due to their high conserved attribute in more than 95% of all collected DENV sequences. Moreover, both of them was found to be immune-relevant by their correspondence to known or putative HLA-restricted T cell determinants. The conserved attribute of these sequences through the entire analysis of this study supports their potential as candidates for further in vitro experiments for rational design a universal vaccine which has longer and broader impact. Keywords: .
Phúc Lâm
93
14
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Transcriptome analysis of copper stress response in rice seedling using DNA microarray
16
66
0
Construction of GmNAC085 vector for future development of drought - tolerant crops
8
51
0
Enhanced growth and development of chrysanthemum morifolium in microponic system under light-emitting diodes
8
69
0
Primary and secondary somatic embryogenesis in jatropha curcas L. from leaf transverse thin cell layers
11
76
0
Gene expression profiling of adp glucose pyrophosphorylase ((AGPase) in sink and source organs of some cassava varieties with different starch contents in Vietnam
10
62
0
Chemical composition and cytotoxic activity of the essential oils of cymbopogon citratus L. grown in Phu Tho province
5
101
0
Cloning cdna sequence coding the KSA-1 lectin from red alga kappaphycus striatum cultivated in Vietnam
9
58
0
Preparation of antibacterial polypropylene grafted acrylic acid and immobilized silver nanoparticles by γ- irradiation method
6
60
0
Biological and taxonomical characteristics of endophytic streptomyces TQR8 14 and its production potential of antimicrobial substance
8
69
0
Identification of white rot fungus CP9 and its potential application in biopulping
6
72
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461846
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22508
57
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10861
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10024
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9488
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8241
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8199
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7859
2219
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6642
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5754
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Sinh học
Journal of Biotechnology
Computational approach for selection of epitope
Dengue vaccine targets
Computational approach for selection
T cell epitope
Transcriptome analysis of copper stress response
Rice seedling using DNA microarray
Activated isoenzymes of superoxide dismutase
The molecular mechanism of rice roots
Construction of GmNAC085 vector for future development
Drought tolerant crops
The model plant Arabidopsis
Plant transformation mediated
Enhanced growth and development of chrysanthemum morifolium
Microponic system under light emitting diodes
Light emitting diodes
Microponic culture system
Primary and secondary somatic embryogenesis
Jatropha curcas L
Leaf transverse thin cell layers
Secondary embryos considerably
Sub cultured onto B5
Gene expression profiling of adp glucose pyrophosphorylase
Sink and source organs
Cassava varieties with different starch contents in Vietnam
ADP glucose pyrophosphorylase
Chemical composition and cytotoxic activity
The essential oils of cymbopogon citratus L
grown
Phu Tho province
The natural sources of anticancer agents
Cloning cdna sequence coding the KSA 1 lectin
Red alga kappaphycus striatum cultivated in Vietnam
Red alga kappaphycus striatum
The cDNA clone
Preparation of antibacterial polypropylene grafted acrylic acid
Immobilized silver nanoparticles by γ irradiation method
γ irradiation method
Grafting functional groups
Biological and taxonomical characteristics
Endophytic streptomyces TQR8 14
Production potential of antimicrobial substance
Produce biologically active secondary metabolites
Activate plant self immunity
Identification of white rot fungus CP9
Potential application in biopulping
The residual enzyme activity
Comparatively well preserved
Optimization for continuous overflow proteolytic hydrolysis
Spent brewer’s yeast by using proteases
Spent brewer’s yeast
Response surface methodology
Effects of maturity stages and fermentation
Cocoa beans on total phenolic contents
Antioxidant capacities in raw cocoa powder
Total phenolic contents
Carotenoid producing bacillus aquimaris found
Chicken gastrointestinal tracts
Screening for heat stable carotenoid producing
Yellow Sporosarcina saromensis
Aromatic hydrocarbon degradation of biofilm formed
Microorganisms on cellulose material at 50 litre modules
50 litre modules
Cellulose material to degrade oil
Treatment of acidic wastewater
Thien Ke tin processing factory
Sulfate reducing bioreactor
A pilot scale study
The treatment of AMD
Vai trò của thụ thể AhR
Aryl hydrocarbon receptor
Ung thư ở người
Nồng độ dioxin cao
An optimized HRM method
An optimized HRM method for diagnosis of G6PD deficiency
Kinh Vietnamese via viangchan mutation
The High Resolution Melting
Cloning expression and purification
M cell specific binding peptide
Fused with CFP
Ni affinity chromatography
Western blot analyses
Co1 GFP fusion protein
Genetic diversity of panax Vietnamensis var
fuscidiscus K
komatsu
S
zhu & S
Cai population
Western north of Vietnam
Simple sequence repeat markers
Turkish Journal of Agriculture and Forestry
Tạp chí Nông Lâm nghiệp
Plant tissue culture
Plant secondary metabolite production
Medicinal and aromatic plants
Strong phyto constituents
Turkish Journal of Botany
Tạp chí Thực vật học
Prunus avium L
Natural populations of wild cherry
Simple sequencing repeat
iNtRON Biotechnology
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Đánh giá hao mòn và độ tin cậy của chi tiết và kết cấu trên đầu máy diezel part 3
12
301
0
19-04-2024
Ebook Quản lý dự án công nghệ thông tin
170
272
5
19-04-2024
beginning Ubuntu Linux phần 1
34
211
1
19-04-2024
extremetech Hacking Firefox phần 7
46
185
0
19-04-2024
MySQL Basics for Visual Learners PHẦN 9
15
183
0
19-04-2024
THE ANTHROPOLOGY OF ONLINE COMMUNITIES BY Samuel M.Wilson and Leighton C. Peterson
19
138
0
19-04-2024
Lịch sử Đội TNTP Hồ Chí Minh - CHƯƠNG III VÂNG LỜI BÁC DẠY, LÀM NGHÌN VIỆC TỐT, CHỐNG MỸ, CỨU NƯỚC, THIẾU NIÊN SĂN SÀNG
45
136
0
19-04-2024
GIÁO TRÌNH MÁY ĐIỆN KHÍ CỤ ĐIỆN - PHẦN I MÁY ĐIỆN - CHƯƠNG 1
46
129
2
19-04-2024
báo cáo hóa học:" Rare ligamentum flavum cyst causing incapacitating lumbar spinal stenosis: Experience with 3 Chinese patients"
4
96
0
19-04-2024
Advanced 3D Game Programming with DirectX - phần 10
67
100
0
19-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7859
2219
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5591
1326
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3749
1228
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8241
1124
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5246
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3471
641
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10861
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3668
524
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4023
513
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4098
478
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.