TAILIEUCHUNG - Bài giảng Tin sinh học đại cương - Chương 3: Bắt cặp trình tự (Sequence Alignment)

Bài giảng Tin sinh học đại cương - Chương 3: Bắt cặp trình tự (Sequence Alignment) giới thiệu chung và tập trung làm rõ hiện tượng bắt cặp hai trình tự, bắt cặp nhiều trình tự. Bài giảng hữu ích với các bạn chuyên ngành Sinh học. | TIN SINH HỌC ĐẠI CƯƠNG (Introduction to Bioinformatics) Chương 3: . Trần Văn Lăng Email: langtv@ . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM BẮT CẶP TRÌNH TỰ (SEQUENCE ALIGNMENT) . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM NỘI DUNG •  Giới thiệu •  Bắt cặp hai trình tự •  Bắt cặp nhiều trình tự . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM MỘT SỐ KHÁI NIỆM CHUNG . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM 1 Nhắc lại •  Sinh vật được tạo thành từ tế bào. •  Bên trong mỗi tế bào - ngoại trừ hồng huyết cầu trưởng thành - có nhân (nucleus) chứa tất cả các chỉ thị di truyền (genetic instruction) •  Những chỉ thị này là chức năng của tế bào •  Các tế bào, với các ngăn khác nhau của nó gọi là bào quan, phải đối mặt với một vấn đề là: –  Tế bào sản xuất các phân tử như kích thích tố, dẫn truyền thần kinh, các cytokine và enzyme –  Chúng phải được gửi đến nơi khác bên trong tế bào, hoặc xuất ra khỏi tế bào. –  Việc sản xuất và vận chuyển này phải được thực hiện đúng nơi và đúng lúc. . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM •  Chẳng hạn, mỗi tế bào người có 46 nhiễm sắc thể, được tổ chức thành 23 cặp. •  Mỗi nhiễm sắc thể được cấu thành bởi một trình tự DNA •  DNA chứa các gen mã hóa RNA mà nó sẽ sinh ra các protein, để từ đó điều chỉnh tất cả các quá trình phát triển của một sinh vật •  Một gene là một đoạn của DNA với trình tự base đặc trưng – cụ thể, gọi là mã di truyền (genetic code), hay chỉ thị di truyền để xác định chức năng của tế bào . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM . Trần Văn Lăng, VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM 2 Khái niệm bắt cặp •  Bắt cặp trình tự, hay là sắp xếp thẳng hàng trình tự (Sequence Alignment) •  Mục đích đạt đến sự giống nhau đến mức tối đa của các trình tự •  Việc bắt cặp được thực .

• Sinh học
• Tin sinh học đại cương
• Bài giảng Tin sinh học đại cương
• Bắt cặp trình tự
• Sequence Alignment
• Bắt cặp hai trình tự
• Bắt cặp nhiều trình tự
• Giới thiều về Tin sinh học
• Lịch sử Tin sinh học
• Định nghĩa Tin sinh học
• Khái niệm trong Tin sinh học
• Tìm kiếm trình tự tương đồng
• Ngân hàng dữ liệu
• Tương đồng trên ngân hàng dữ liệu
• Cấu trúc PDB
• Phân tích trình tự DNA
• Chuyển đổi trình tự DNA
• Dự đoán gene
• Cách tìm motif
• Tiến hóa phân tử
• Cây phân loại
• Nguồn gốc cây phân loài
• Phương pháp xây dựng cây phân loài
• Đề xuất trong việc cải tiến
• Cải tiến nội dung môn Tin học đại cương
• Tin học đại cương
• Hỗ trợ quá trình tự học
• Nâng cao quá trình tự học của sinh viên
• Bài tập Tin học đại cương
• Ôn thi HS giỏi Tin
• Nhập xuất dữ liệu
• Ngôn ngữ lập trình Pascal cơ bản
• Bài giảng Vi sinh vật đại cương
• Vi sinh vật đại cương
• Vi sinh vật
• Di truyền học vi sinh vật
• Vai trò của plasmid
• Phương thức vận chuyển vật chất thông tin
• tài liệu luyện thi đại học
• đề cương ôn thi sinh học
• bài tập sinh học
• toán di truyền
• công thức sinh học bài tập trắc nghiệm
• tài liệu ôn thi đại học
• ngân hàng đề thi trắc nghiệm
• ôn tập sinh học
• sổ tay sinh học
• Luật đa dạng sinh học
• Sinh vật ngoại lai
• Loài bị đe dọa
• Thủy sinh lạ
• Thủy vực Việt Nam
• Công nghệ sinh học
• Sinh học phát triển
• Sinh học đại cương
• Tin Sinh học
• Đại cương về internet
• Cơ sở dữ liệu công nghệ sinh học
• Cấu trúc chuỗi DNA
• Cấu trúc chuỗi Clustalw
• Cấu trúc không gian Cn3D
• Tra cứu dữ liệu qua internet
• Cơ sở dữ liệu để thiết kế gen
• Luận án Tiến sĩ Khoa học giáo dục
• Khoa học giáo dục
• Ứng dụng điện toán đám mây
• Tổ chức dạy học
• Tiểu luận kinh tế chính trị
• Tiểu luận về văn hóa Việt Nam
• Đồ án Tin học
• Thực trạng đạo đức sinh viên hiện nay
• Đồ án tin học đại cương
• Đề tài lối sống sinh viên hiện nay
• Đổi mới hình thức tổ chức dạy học
• Điện toán đám mây
• Dạy học Tin học đại cương
• Phần mềm hỗ trợ dạy học
• phần mềm tin học
• hệ thông thông tin
• tài liệu học đại học
• giáo trình đại cương
• đề cương bài giảng
• Kiến trúc máy tính
• đề cương ôn tập
• hướng dẫn học thi tin
• lập trình ngôn ngữ
• kiểu dữ liệu
• cấu trúc lập trình
• cấu trúc lệnh khối
• chuyên đề sinh học
• màng tế bào
• thông tin qua màng
• tế bào nhân sơ
• Cơ sở dữ liệu
• Chương trình phân tích cấu trúc chuỗi
• Tra cứu dữ liệu
• Đa dạng sinh học
• Sinh thái học
• Triết lý về động vật học
• Nguồn gốc của muôn loài
• Tạp chí Giáo dục
• Bài viết về giáo dục
• Thảo luận nhóm
• Pháp luật đại cương
• Đào tạo theo hệ thống tín chỉ
• Đổi mới đánh giá kết quả học tập
• Lý luận chính trị
• Học chế tín chỉ
• Nâng cao chất lượng dạy học