TAILIEUCHUNG - Sàng lọc và nhân dòng gen mã hóa pectate lyase từ bacillus subtilis có nguồn gốc Việt Nam

Trong bài báo này, chúng tôi công bố nghiên cứu về sàng lọc các chủng B. subtilis sinh pectate lyase phân lập từ Việt Nam từ các bộ sưu tập chủng giống trong nước, kết quả nhân dòng và giải trình tự các gen này, đồng thời so sánh trình tự amino acid của chúng với các gen cùng loại đã biết trên ngân hàng gen để góp phần hiểu biết thêm về tính đa dạng của enzyme này. | TẠP CHÍ SINH HỌC, 2012, 34(4): 485-492 SÀNG LỌC VÀ NHÂN DÒNG GEN MÃ HÓA PECTATE LYASE TỪ Bacillus subtilis CÓ NGUỒN GỐC VIỆT NAM Đỗ Thị Thu Hằng, Võ Hoài Bắc*, Lê Văn Trường Viện Công nghệ sinh học, *vh_bac@ TÓM TẮT: Pectate lyase (PL) là enzyme quan trọng trong bệnh thực vật do vi sinh vật tiết ra. PL phân hủy polygalacturonate của thành tế bào thực vật tạo ra các oligogalacturonate. Trong bài báo này chúng tôi công bố kết quả sàng lọc được 9 chủng Bacillus subtilis nguồn gốc Việt Nam có khả năng sản xuất pectate lyase cao. pH tối ưu phản ứng phân hủy popygalacturonate của các enzyme này từ 8,5-10. Gen mã hóa pectate lyase (pel) của bốn chủng B. subtilis khác nhau đã được cloning trong E. coli và giải trình tự gen. Pectate lyase của 4 chủng vi khuẩn này có 420 amino acid (aa). Trình tự amino acid suy diễn của các enzyme này có độ tương đồng từ 98,8-99,8% so với trình tự amino acid của pectate lyase từ chủng B. subtilis 168. Có 10 vị trí amino acid bị thay đổi trong trình tự aa của 4 pectate lyase khi so sánh giữa chúng với nhau. Trình tự aa của PL từ các chủng phân lập từ thực vật bảo thủ hơn các chủng phân lập từ đất khi so sánh chúng với PL của B. subtilis 168. Từ khóa: Bacillus subtilis, endopolygalacturonate lyase, nhân dòng gen, pectate lyase, pectin acid. MỞ ĐẦU Pectate lyase (PL) hay endopolygalacturonate lyase (EC ) là enzyme quan trọng trong bệnh thực vật do vi sinh vật gây ra [2]. Enzyme này phân cắt ngẫu nhiên liên kết α-1,4 glycosidic của polygalacturonate trong thành tế bào thực vật thông qua phản ứng ß-elimination tạo ra các oligogalacturonate có liên kết đôi giữa C4 và C5 ở đầu đường không khử [2]. PL thường thấy trong các vi sinh vật gây bệnh thực vật như vi khuẩn E. chrisanthemi [9], E. carotovo [10], B. subtilis [14], nấm mốc [8]. Gần đây, PL cũng đã được tìm thấy trong vi khuẩn ưa lạnh P. haloplanktis phân lập từ biển Nam cực [20]. Pectate lyase xúc tác phản ứng phân cắt cơ chất pectin và pectin acid (polygalacturonate) ở pH .

• Sinh học
• Tạp chí khoa học
• Tạp chí sinh học
• Nhân dòng gen
• Sàng lọc gen
• Tính đa dạng của enzyme
• Bệnh ở thực vật
• Xứng đáng tạp chí khoa học
• Tạp chí khoa học chuyên ngành
• Tìm hiểu tạp chí khoa học
• Giới thiệu tạp chí khoa học
• Tài liệu tạp chí khoa học
• Chất lượng tạp chí khoa học
• Hoạt động nghiên cứu khoa học
• Phát triển Tạp chí khoa học
• Nâng cao chất lượng Tạp chí khoa học
• Chuyển đổi số tạp chí khoa học
• Mục lục Tạp chí
• Tổng Mục lục Tạp chí Khoa học xã hội Việt Nam
• Tổng Mục lục Tạp chí Khoa học xã hội
• Tạp chí Khoa học xã hội
• Tạp chí Khoa học xã hội Việt Nam
• Tạp chí khoa học Việt Nam
• Phản biện khoa học
• Phản biện xã hội
• Hệ thống tạp chí khoa học
• Thực trạng hệ thống tạp chí khoa học
• Ưu điểm hệ thống tạp chí khoa học
• Hệ thống tạp chí khoa học Việt Nam
• Ấn phẩm khoa học
• Hệ thống tạp chí
• Dữ liệu tạp chí Việt Nam
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ
• Khoa học và Công nghệ Việt Nam
• Khoa học và Công nghệ Việt Nam năm 2020
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ số 1+2A
• Startup Việt Nam
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ số 3A
• Ứng dụng tế bào gốc
• Dữ liệu ảnh Landsat đa thời gian
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ số 3B
• Địa tầng và địa mạo đảo Lý Sơn
• Cà phê hòa tan ở Việt Nam
• Tạp chí khoa học
• Bài báo khoa học
• Giải pháp xây dựng tạp chí khoa học
• Tiếu chí tạp chí khoa học theo tiêu chuẩn quốc tế
• Tiêu chuẩn quốc tế về tạp chí khoa học
• Phân loại tạp chí khoa học
• Phân loại tạp chí
• Mã số quốc tế
• Trang điện tử của tạp chí và sách
• Hội nhập quốc tế
• Các tạp chí khoa học ở Việt Nam
• Hội nhập quốc tế của các tạp chí
• Thực trạng hội nhập quốc tế tạp chí
• Tạp chí Khoa học Công nghệ Việt Nam
• Tổng mục lục tạp chí
• Tạp chí thông tin Khoa học xã hội
• Khoa học xã hội
• Tổng hợp tạp chí Khoa học xã hội 2016
• Tạp chí nghiên cứu và không gian khoa học
• Tạp chí nghiên cứu
• Không gian khoa học
• Nghiên cứu khoa học
• Đề tài nghiên cứu khoa học cấp trường
• Hệ thống phân loại tạp chí
• Tạp chí ISI
• Quản lý hoạt động của tạp chí
• Tạp chí Kinh tế đối ngoại
• Quản lý báo chí
• Hoạt động quản lý tạp chí khoa học
• Báo cáo luật sửa đổi bổ sung
• Báo cáo khoa học luật
• Báo cáo nghiên cứu khoa học
• Tạp chí khoa học luật
• Phát triển Học viện Ngân hàng
• Tạp chí Khoa học và Đào tạo Ngân hàng
• Thông tin Khoa học Ngân hàng
• Nâng cao chất lượng tạp chí
• Tạp chí khoa học và công nghệ số 4
• Tạp chí khoa học và công nghệ năm 2014
• Cấu trúc giếng lượng tử silicon
• Công thức khai triển nghiệm đa thức
• Cấu trúc giếng lượng tử
• Tiêu chuẩn quốc tế của tạp chí khoa học
• Tiêu chuẩn quốc tế của tạp chí
• Tiêu chuẩn quốc tế
• Viện Thông tin khoa học Mỹ
• Cơ sở dữ liệu
• Khoa học xã hội Việt Nam
• Tạp chí Việt Nam
• Nâng cao chất lượng tạp chí khoa học xã hội
• Tạp chí Khoa học Kỹ thuật
• Quản lý Tạp chí Khoa học Kỹ thuật
• Khoa học Kỹ thuật Mỏ Địa chất
• Công nghệ thông tin quản lý tạp chí
• Hệ thống tiện ích của Internet
• Tự động hóa quy trình quản lý
• Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y
• Kỹ thuật Thú y
• Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y số 3
• Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y năm 2019
• Dịch tả lợn châu Phi
• Vi khuẩn Escherichia coli trên giống vịt biển
• Tạp chí Nghiên cứu và Phát triển
• Khoa học Tập chí
• Tạp chí phổ biến khoa học đầu tiên
• Ban biên tập
• Cộng tác viên
• Khoa học và Công nghệ
• Khoa học kỹ thuật
• Khoa học tự nhiên