TAILIEUCHUNG - Giải trình tự gen 16s - rRNA của các loài cua xanh (scylla paramamosain) và xác định quan hệ di truyền

Trên cơ sở phân tích đặc điểm phân tử đoạn trình tự này, đã định loại ba mẫu cua trên thuộc loài Scylla paramamosain phân bố ở vùng biển Việt Nam. Tiến hành xây dựng cây phát sinh loài và đánh giá quan hệ di truyền của sáu quần thể cua xanh thuộc chi Scylla và ba loài cua thuộc chi khác, kết quả phân loại thành sáu nhóm cua dựa trên trình tự 16S-rRNA. | TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC VĂN LANG Trƣơng Thế Quang GIẢI TRÌNH TỰ GEN 16S-rRNA CỦA CÁC LOÀI CUA XANH (SCYLLA PARAMAMOSAIN) VÀ XÁC ĐỊNH QUAN HỆ DI TRUYỀN 16S-rRNA GENE SEQUENCING OF MUD CRAB SPECIES (SCYLLA PARAMAMOSAIN) AND DETERMINATION OF GENETIC RELATIONSHIP TRƯƠNG THẾ QUANG TÓM TẮT: Tách chiết và thu nhận được DNA tổng số của ba loài cua xanh Cần Giờ, Bến Tre, Cà Mau bằng phương pháp trích ly cột silica. Hiệu chỉnh thành công quy trình PCR khuếch đại vùng gen ty thể 16S ribosomal RNA (16S-rRNA) bằng cặp mồi M13U16S-F và M13U16S-R. So sánh trình tự gen 16S-rRNA của cua xanh trên GenBank có độ bao phủ và tương đồng đạt hơn 99% cho thấy mẫu vật thu thập ngoài thực địa không bị lẫn tạp các mẫu khác. Đã xác định được trình tự gen 16S-rRNA của loài cua xanh có kích thước phân tử 511 bp. Trên cơ sở phân tích đặc điểm phân tử đoạn trình tự này, đã định loại ba mẫu cua trên thuộc loài Scylla paramamosain phân bố ở vùng biển Việt Nam. Tiến hành xây dựng cây phát sinh loài và đánh giá quan hệ di truyền của sáu quần thể cua xanh thuộc chi Scylla và ba loài cua thuộc chi khác, kết quả phân loại thành sáu nhóm cua dựa trên trình tự 16S-rRNA. Từ khóa: cua xanh, 16S-rRNA, cây phát sinh loài. ABSTRACT: Extract and obtain the total DNA of three mud crab species in Can Gio, Ben Tre and Ca Mau by silica column extraction method. Successful modification of the PCR process amplified 16S ribosomal RNA (16S-rRNA) gene by M13U16S-F and M13U16S-R primers. Comparison of the 16S-rRNA gene sequences of blue crabs on GenBank with over 99% coverage and homology showed that specimens collected in the field were not mixed with other samples. The 16S-rRNA gene sequences of blue crabs with 511 bp molecular size were determined. Based on molecular analysis of this sequence, above three samples of crabs were identified as kind of Scylla paramamosain that distributed in the sea of Vietnam. Constructing phylogenetic tree and evaluate genetic relationships of six populations of blue crabs of the

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
19    154    3
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.