TAILIEUCHUNG - Tính năng lượng tự do Hydrat hoá của chất tương tự Axit amin bằng phương pháp động lực phân tử

Bài báo đề cập đến tính toán động lực phân tử của năng lượng sol-fi fi-ee của một số amino tương tự chuỗi axit bên trong nước bằng GROMACS sofh \ 'là và theo sau tính toán Dillgroup thủ tục. | Tap chi Hoa hoc, T. 47 (6), Tr. 709 - 715, 2009 TINH NANG LLfONG TL/ DO HYDRAT HOA CUA CHAT TUONG TL/ AXIT AMIN BANG PHUONG PHAP DONG LL/C PHAN TLT Den Tda soan 24-12-2008 DANG UNG VAN', NGUYEN HOA MY' ' Trucmg Dai hgc Hod Binh, Hd Ngi 'Trung tdm dng dung tin trong hod hgc, DH Khoa hgc Tu nhien, DHQG Hd Ngi ABSTRACT The paper deals with molecular dynamics calculation of solvation fi-ee energy of some amino acid side chain analogs in water by GROMACS sofh\'are and following Dillgroup calculation procedure. We calculated the fi-ee energy for turning off the Lennard-Jones interactions of 8 amino acid analogs including methane/Ala, n-hutan/Ile, isohutan/Leu, propane/Val, acetamid/Asn, p-cresol/Tyr, etanol/Thr and metanollSer represented with the OP ES-AA force field in TIP3P water models. We achieved a high degree of statistical precision in molecular dynamic simulations and by thermodynamic intergration method obtained the deviation of calculated fi'ee energy of hydration of about - kcal/mol fi'om the experimental hydration fiee energy measurements of the same molecules. I - M O DAU Tfnh loan nang lugng tu do la mdt trong nhiing viec khd nha't va tdn kem thdi gian may nha't eiia dgng luc phan tir. Tuy vay, vl nguyen tac, phuang phap nay cho kit qua kha phii hgp vdi thuc nghiem va cd the du bao chfnh xac nang lugng tu do ciia cac qua trinh hoa ly [1] khdng kem theo viec cit diit va hinh thinh cac lien kit cdng hoa tri, vf du nhu qua trinh xonvat hoa. qua trinh tao phirc Michaelis giira phd'i tir va protein . Kit qui tinh toan nang lutpng tu do thucmg rat nhay vai viec lua chgn mdt sd dilu kien bien vdn khong quan trong ddi vdi phep tfnh ddng luc phan tir thdng thudng. Vf du nhu khi xir ly phin khoang tac dung xa cua luc Coulomb bing thuat toan ludi hat Ewald (PME), cac tham sd PME vdn dii diing cho cac tfnh toan dong luc phan tu thdng thudng thi lai cd the cho sai sd nghiem trgng trong viec tfnh toan nang luang tu do ciia qua trinh thay ddi dien .

• Hoá học
• Tạp chí hóa học
• Tính năng lượng tự do Hydrat hoá
• Chất tương tự Axit amin
• Phương pháp động lực phân tử
• Năng lượng tự do
• Chủ tịch Hồ Chí Minh
• Nhà văn hóa Hồ Chí Minh
• Nhân cách văn hóa Hồ Chí Minh
• Quan điểm văn hóa Hồ Chí Minh
• Sự nghiệp văn hóa của Hồ Chí Minh
• Tạp chí Đại học Trà Vinh
• Tạp chí Khoa học Kỹ thuật
• Quản lý Tạp chí Khoa học Kỹ thuật
• Khoa học Kỹ thuật Mỏ Địa chất
• Công nghệ thông tin quản lý tạp chí
• Hệ thống tiện ích của Internet
• Tự động hóa quy trình quản lý
• Tạp chí dạy và học hóa học
• Công thức giải nhanh trắc nghiệm hóa học
• Giải nhanh trắc nghiệm hóa học
• Hướng dẫn giải bài tập hóa học
• Hướng dẫn giải trắc nghiệm hóa học
• Giải nhanh bài tập trắc nghiệm hóa học
• Kĩ thuật giải nhanh trắc nghiệm hóa học
• Phương pháp giải nhanh trắc nghiệm hóa học
• Phương pháp bảo toàn khối lượng
• Giải nhanh trắc nghiệm Hóa học 185
• Kĩ thuật giải nhanh bài tập trắc nghiệm
• Ôn tập Hóa học
• Tạp chí khoa học
• Tạp chí sinh học
• Khả năng chống oxi hóa
• Phương pháp đáp ứng bề mặt
• Điều kiện tối ưu hóa tách chiết
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ
• Khoa học và Công nghệ Việt Nam
• Khoa học và Công nghệ Việt Nam năm 2018
• Thương mại hóa sáng chế
• Khoa học và Công nghệ Việt Nam năm 2017
• Thành phần chất nhũ hóa
• Tạp chí Toán học
• Toán học và Tuổi trẻ
• Tạp chí Toán học số 232
• Đặc biệt hóa bài toán
• Con mắt lượng giác
• Điền số vào hình lục giác
• Tạp chí Khoa học Biến đổi khí hậu
• Tạp chí Khoa học Biến đổi khí hậu số 8
• Mạng lưới giám sát lắng đọng a xít
• Công nghệ tự động hóa quan trắc gió
• Ứng dụng mô hình WRF CMAQ
• Tạp chí Khoa học Công nghệ
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ Hạt nhân
• Bức xạ ion hóa
• Điều trị ung thư
• Xạ trị ung thư phổi không tế bào nhỏ
• Module tổng hợp 18F NaF
• Chất hoạt hóa bề mặt sinh học
• Phương pháp bề mặt đáp ứng
• Tối ưu hóa môi trường
• Nam Phong tạp chí
• Truyện Kiều
• Thơ vịnh Kiều
• Khoa học tạp chí
• Social science
• Hiện đại hóa văn học Việt Nam
• Luận án Tiến sĩ
• Luận án Tiến sĩ Ngữ văn
• Văn học Việt Nam
• Đông Dương tạp chí
• Hiện đại hóa văn học
• Văn hóa Việt Nam
• Định vị thương mại hóa báo chí
• Thương mại hóa báo chí
• Báo chí ở Việt Nam
• Kỉ nguyên số
• Tạp chí Triết học
• Tạp chí Triết học Số 5 năm 2001
• Nghị quyết IX của Đảng
• Thực tiễn cuộc sống
• Tư tưởng Hồ Chí Minh
• Toàn cầu hóa
• Chỉ số nhũ hóa
• Phân hủy dầu thô
• Công nghệ sinh học
• Tạp chí Dược liệu
• Tạp chí Dược liệu tập 5
• Flavonoid từ vỏ cây xoan trà
• Thành phần hóa học của cây ô dược
• Định lượng Sulfat Rotundin dạng tinh thể
• Tạp chí Giáo dục Đại học Quốc tế
• Bài viết về giáo dục
• Toàn cầu hóa hiệu trưởng
• Quốc tế hóa các trường đại học
• Quốc tế hóa giáo dục đại học
• Trắc nghiệm hóa học
• Phương pháp giải hóa học
• Bài tập trắc nghiệm hóa học
• Giải bài tập hóa học
• Kỹ năng giải nhanh hóa học
• Tạp chí nông nghiệp
• Cải tạo vườn tạp
• Nâng cao hiệu quả sử dụng đất đai
• Mô hình canh tác
• Tài nguyên đất
• Tối ưu hóa lợi nhuận nông hộ
• Tạp chí Nghiên cứu và Phát triển
• Địa chí văn hóa dân gian Nghệ Tĩnh
• Học giả Nguyễn Đổng Chi
• Văn hóa dân gian xứ Nghệ
• Sách địa chí
• Báo cáo khoa học tự nhiên
• Đề tài nghiên cứu khoa học
• Phương pháp nghiên cứu khoa học
• Nghiên cứu khoa học
• Báo cáo nghiên cứu khoa học
• Tạp chí y dược
• Y dược quân sự
• Đông trùng hạ thảo
• Chỉ số chống oxy hóa
• Sinh hóa chức năng gan
• Hóa chất bảo vệ thực vật
• Thực hành sử dụng hóa chất