Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Sinh học
Phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran based on partial sequence data from the fusion (F) protein gene
TAILIEUCHUNG - Phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran based on partial sequence data from the fusion (F) protein gene
In order to gain some insight into the origin of the peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran, a selected region of the PPRV genome in a clinical sample collected from a sheep was amplified using RT-PCR, and the resulting amplicon was sequenced for phylogenetic analysis. | Turk J Biol 35 (2011) 45-50 © TÜBİTAK doi: Phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran based on partial sequence data from the fusion (F) protein gene Majid ESMAELIZAD1, Saber JELOKHANI-NIARAKI1, Rohani KARGAR-MOAKHAR2 1Department of Biotechnology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj - IRAN 2Department of virology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj - IRAN Received: Abstract: In order to gain some insight into the origin of the peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran, a selected region of the PPRV genome in a clinical sample collected from a sheep was amplified using RT-PCR, and the resulting amplicon was sequenced for phylogenetic analysis. The partial nucleotide and predicted amino acid sequence of the Iranian isolate was aligned with the corresponding sequences of 16 previously published F genes. Sequence analysis of the strains showed that the Iranian isolate had the highest degree of homology with the majority of the strains, with the exception of Nigerian isolates and ICV89. In general, a higher degree of amino acid sequence conservation was observed among the various strains of field PPRV. Phylogenetic comparison of the Iranian isolate, along with some published exotic sequences, indicated that the virus has been circulating for years in Iran’s neighboring countries, including Turkey and Pakistan. Overall analysis of the amino acid and nucleotide substitutions showed that ICV89 from Ivory Coast was more prone to sequence alterations than the others were. The phylogenetic tree created for F protein nucleotide data was divided into 4 separate lineages. All strains were conserved within the cleavage site of the amino acid sequence, except for Mdn96. Analysis of the sequence data showed that PPRV circulation has been homologous in Asian countries. Determination of the nucleotide sequence of the partial F protein of the Iranian isolate would help .
Kim Tuyền
60
6
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Molecular and phylogenetic analysis of Mycoplasma gallisepticum in Haryana, India
6
69
0
Cloning, sequencing and phylogenetic analysis of inv E gene of salmonella typhimurium
8
44
1
Isolation and identification of Listeria monocytogenes from fish intestines and phylogenetic analysis
11
47
1
Morphological, karyological and phylogenetic evaluation of Cyclotrichium: A piece in the tribe Mentheae puzzle
12
75
0
Phylogenetic diversity analysis of Ralstonia Solanacearum, Pseudomonas Fluorescens and Trichoderma Asperellum isolated from tomato Rhizosphere soil in Karnataka
8
83
0
Phylogenetic analysis of 28S rRNA gene of indigenous xiphinema pachydermum
9
64
0
Glycoprotein based phylogenetic analysis of rabies virus isolates
8
46
1
Molecular cloning, phylogenetic analysis, and expression profiling of endoplasmic reticulum molecular chaperone BiP genes from bread wheat (Triticum aestivum L.)
16
62
0
Few selected human transcription factors sequence analysis and their phylogenetic relationship
10
37
1
Molecular characterization and phylogenetic analysis of bovine ephemeral fever viruses in Khuzestan province of Iran in 2018 and 2020
12
8
1
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461857
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22593
58
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10882
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10047
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9513
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8267
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8216
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7862
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6669
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5765
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Sinh học
Phylogenetic analysis
Peste des petits ruminants virus
PPRV genome
Viral RNA
Vero cell monolayer cultures
Mycoplasma gallisepticum
Molecular and phylogenetic analysis
Sequencing and phylogenetic analysis
Inv E gene
Inv E gene of salmonella typhimurium
Salmonella typhimurium
Listeria monocytogenes
Labeo catla (Catla fish)
Dasyatis pastinaca (Stingrays fish)
Genus Cyclotrichium
Phylogenetic evaluation of Cyclotrichium
Morphological revision
Cytogenetic properties
Molecular identification
Phylogenetic tree
PCR amplification
Phylogenetic diversity analysis
Ralstonia Solanacearum
Pseudomonas Fluorescens
28S rRNA gene
Indigenous xiphinema pachydermum
Phylogenetic trees
Xiphinema pachydermum
Strain specific PCR
Glycoprotein based phylogenetic analysis
Rabies virus isolates
Rabies virus in canids
Glycoprotein sequence based phylogenetic
BMC Plant Biology
HMW GS silencing
Drought stress
Molecular cloning
BiP genes
Triticum aestivum L
Human transcription
Phylogenetic relationship
Few selected human transcription
Factors sequence analysis
Computational methods
BMC Veterinary Research
Bovine ephemeral fever virus
Molecular characterization
Nasal discharge
Porcine circovirus 3
Open reading frames
Viral capsid
Hepatitis E
Zoonotic disease
Pig blood
Molecular detection
Lumpy skin disease
Infectious viral disease
Roe deer
Next generation sequencing
Taxonomic classification
Molecular relationship
Foot and mouth disease virus serotype
Indian vaccine strain
World by phylogenetic analysis
Turkish Journal of Botany
Tạp chí Thực vật học
Tripleurospermum eskilensis
Morphological characters
Molecular phylogenetic analysis
Gossypium sp
SSR marker
Cluster analysis
Genetic diversity
Phylogenetic relationships
Potential cotton
Pseudoroegneria species
Chloroplast trnL F sequences
Chloroplast DNA
ITS sequences
MatK sequences
Molecular phylogenetic
Onobrychis species
Onobrychis Mill
Internal transcribed spacers
Genus Aeschynomene
Phylogenetic framework
Nod dependent
Nod independent symbioses
Genetic relationship
Genetic distance
Microsatellite markers
Zebu cattle
BMC Bioinformatics
Genome evolution
Regulatory evolution
Genomic algorithms
Ancestral reconstruction
Salmonella enterica
16S RNA
Biochemical tests
Salmonella enterica based on 16S RNA
Taxonomic identification
Phylogenetic position
Archaeal organisms
16S DNA sequences
Plant Biology
Chloroplast genome
Molecular markers
Species identification
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
CẤU TẠO HẠT NHÂN NGUYÊN TỬ-ĐỘ HỤT KHỐI-NĂNG LƯỢNG LIÊN KẾT-LK RIÊNG
12
264
0
24-04-2024
Oreilly learning the vi Editor phần 4
19
228
0
24-04-2024
Bibliography on Medieval Women, Gender, and Medicine 1980-2009
82
207
0
24-04-2024
BeginningMac OS X Tiger Dashboard Widget Development 2006 phần 2
34
208
0
24-04-2024
Magnetic Bearings Theory and Applications phần 2
14
170
0
24-04-2024
Bơm máy nén quạt trong công nghiệp part 8
20
198
2
24-04-2024
Công nghiệp gang thép Việt Nam : Một giai đoạn phát triển và chuyển đổi chính sách mới part 5
6
194
0
24-04-2024
MySQL Database Usage & Administration PHẦN 7
37
154
0
24-04-2024
MySQL Database Usage & Administration PHẦN 9
37
141
0
24-04-2024
Hướng dẫn sử dụng Quickoffice cho Ipad và Iphone
13
150
0
24-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7862
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5674
1348
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3757
1230
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5307
1135
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8267
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3483
641
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10882
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3677
525
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4039
514
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4120
480
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.