TAILIEUCHUNG - Identification of root knot nematodes in the mediterranean region of Turkey by using rDNA and mtDNA markers

Fragments containing the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal rDNA were amplified from Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria and M. hapla by polymerase chain reaction (PCR). | Turk J Agric For 26 (2002) 337-341 © TÜB‹TAK Identification of Root-Knot Nematodes in the Mediterranean Region of Turkey by Using rDNA and mtDNA Markers Zübeyir DEVRAN Citrus and Greenhouse Crops Research Institute, Antalya - TURKEY U¤ur GÖZEL, M. Ali SÖ⁄ÜT, fienol YILDIZ, ‹. Halil ELEKÇ‹O⁄LU Çukurova University, Agriculture Faculty, Plant Protection Department, Adana - TURKEY Received: Abstract: Fragments containing the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal rDNA were amplified from Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria and M. hapla by polymerase chain reaction (PCR). Only digestion of the ITS region with the enzyme RsaI significantly distinguished M. hapla from other species, while other enzymes, EcoRI and BamHI, were not effective in distinguishing these nematode species. PCR was also done with mitocondrial DNA (mtDNA) markers for species discrimination. The obtained amplification product of 600 bp was digested with HinfI restriction endonuclease allowing discrimination among the four root-knot species. mtDNA was found to be a useful tool for discriminating between the important Meloidogyne species in this study. Key Words: Root-nematodes, rDNA, mtDNA, diagnostics Türkiye’nin Akdeniz Bölgesindeki Kök Ur Nematodlar›n›n rDNA ve mtDNA Markerleri ile Tan›mlanmas› Özet: Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria ve M. hapla’n›n rDNA’s›n›n ITS bölgesini içeren fragmentler PCR ile ço¤alt›lm›flt›r. ITS bölgesinin RsaI enzimi ile kesimi sonucu M. hapla di¤er türlerden ayr›lm›flt›r. EcoRI ve BamHI enzimlerinin bu türleri ay›rmada etkisiz oldu¤u belirlenmifltir. Bu nedenle di¤er türleri ay›rmada mtDNA markerleri kullan›lm›flt›r. PCR sonucu elde edilen 600 bp’l›k fragment HinfI restriction enzimi ile kesilerek türler birbirlerinden ayr›lm›flt›r. Bu çal›flmada mtDNA’n›n önemli Meloidogyne türlerini ay›rmada faydal› bir araç olabilece¤i bulunmufltur. Anahtar Sözcükler: Kök ur nematodlar›, rDNA, mtDNA, teflhis Introduction Turkey has a .

TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.